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Valorisation entreprise innovante : spécificités des biotech, deeptech et startups

Publication :  
03.02.2026
valorisation entreprise innovante biotech deeptech

Valoriser une entreprise innovante n’a rien à voir avec la valorisation d’une startup « classique ». Biotech, deeptech, hardware, technologies de rupture… Ces modèles sont portés par des cycles longs, un risque scientifique élevé et des jalons critiques qui conditionnent toute la trajectoire de création de valeur.

Chez Sovalue, nous accompagnons des centaines d’entreprises technologiques et observons toujours la même chose : la valeur d’une entreprise innovante se construit différemment, car elle dépend avant tout de sa science, de son rythme de développement et de la probabilité de réussir les prochaines étapes clés.

Cet article vous aide à comprendre pourquoi la valorisation des entreprises innovantes nécessite des méthodes spécifiques et quels critères les investisseurs spécialisés analysent réellement.

Pourquoi valoriser une entreprise innovante est fondamentalement différent

Des modèles économiques non linéaires et difficiles à prédire

Dans les biotech, deeptech et projets industriels, la valeur ne progresse pas de manière continue. Elle évolue par sauts, au rythme des étapes techniques suivantes :

  • validation d’un prototype ;
  • passage de TRL (Technology Readiness Levels) ;
  • résultats précliniques ou cliniques ;
  • tests industriels ;
  • certification réglementaire, etc.

Chaque jalon réussi augmente brutalement la valeur. Chaque jalon manqué la diminue tout aussi brutalement.

C’est ce qui rend les approches classiques de valorisation inadaptées.

Un niveau d’incertitude beaucoup plus élevé

Les entreprises innovantes portent non seulement un risque business, mais aussi :

  • un risque technologique (la science/tech peut ne pas fonctionner) ;
  • un risque réglementaire (normes, certifications) ;
  • un risque marché (adoption progressive ou incertaine).

C’est cette triple incertitude qui rend la valorisation d’une entreprise innovante très différente de celle d’une startup SaaS ou marketplace classique.

💡 Pour ce volet plus général, notre article « Valorisation startup : critères retenus par les investisseurs » vous apportera un complément utile.

Des cycles d’investissement longs et capitalistiques

Les entreprises Tech innovantes consomment beaucoup de capital avant d’atteindre leur mise sur le marché :

  • plusieurs années de R&D ;
  • industrialisation ;
  • essais cliniques ;
  • conformité réglementaire.

La valorisation doit donc intégrer non seulement la valeur future, mais aussi le coût total pour l’atteindre et la dilution induite par les levées successives.

Quand faire une valorisation pour une entreprise innovante ?

Voici les moments où une valorisation devient particulièrement utile :

  • avant une levée de fonds deeptech ou biotech ;
  • après la réussite d’un jalon technique majeur ;
  • avant un partenariat industriel ou un licensing ;
  • pour structurer une roadmap R&D et un plan de financement ;
  • pour valoriser des BSPCE dans un contexte technologique non linéaire ;
  • avant une entrée au capital d’un corporate ou d’un fonds spécialisé.

👉 Si vous êtes dans l’une de ces situations, un échange avec un analyste Sovalue peut vous aider à structurer vos hypothèses et à anticiper votre valorisation. Prenez RDV.

Les critères qui comptent vraiment pour les investisseurs spécialisés

Les jalons R&D : la source principale de création de valeur

C’est le critère numéro 1.

Les investisseurs ne valorisent pas la technologie « en général », mais la probabilité que le prochain jalon soit franchi. Un TRL franchi, une preuve de concept validée ou une phase clinique réussie peuvent doubler, voire tripler, une valorisation.

C’est précisément pour modéliser ces scénarios que les méthodes par options réelles sont adaptées aux entreprises innovantes.

💡 À lire aussi : « Méthodes de valorisation : quelle approche choisir pour votre entreprise ? » pour bien comprendre les différentes approches, leurs avantages et leurs limites. 

La propriété intellectuelle et l’avantage technologique

Les investisseurs analysent :

  • la solidité des brevets ;
  • la liberté d’exploitation (FTO) ;
  • la barrière technologique réelle ;
  • la difficulté de répliquer la solution (barrière à l’entrée).

Une innovation sans propriété intellectuelle forte est rarement valorisée à son plein potentiel.

L’équipe technique et scientifique

En deeptech et biotech, l’équipe compte souvent autant que la technologie.

Les VCs évaluent :

  • l’expérience du ou de la CTO/CSO ;
  • la qualité du leadership scientifique ;
  • l’historique de recherche ;
  • la capacité à exécuter rapidement.

Une équipe forte réduit le risque, donc augmente la valorisation.

Le marché adressable et la stratégie d’industrialisation

Même une technologie exceptionnelle a besoin d’un marché crédible.

Sont pris en compte :

  • la taille réelle du TAM (Total Adressable Market) ;
  • la maturité du marché ;
  • les applications concrètes à court terme ;
  • la capacité à industrialiser.

Un marché trop théorique = valorisation réduite.

Un marché prouvé et mesurable = valorisation plus élevée.

Les approches de valorisation adaptées aux entreprises innovantes

Méthode des Real Options : la plus pertinente

Elle permet d’intégrer :

  • la probabilité de réussir chaque étape ;
  • la valeur créée à chaque jalon ;
  • les différents scénarios (succès total, partiel, pivot, arrêt).

C’est l’outil le plus juste pour modéliser des trajectoires complexes et séquentielles.

DCF ajusté au risque technologique

Le DCF (Discounted Cash-Flow) classique n’est pas adapté aux entreprises innovantes… Sauf pour les entreprises plus matures et d’intégrer :

  • un temps d’horizon plus long ;
  • un risque de développement technologique ;
  • différents scénarios de développement.

Il devient alors utile en complément à une méthode de Real Options.

Comparables spécialisés biotech/deeptech

Les comparables SaaS ou marketplace sont inutiles ici. 

Il faut plutôt analyser :

  • des acquisitions biotech ;
  • des deals deeptech ;
  • des transactions industrielles ;
  • des valorisations de plateformes de R&D.

Notre méthodologie de valorisation utilise notamment une large base de données d’entreprises technologiques pour trouver des comparables réellement pertinents.

Les erreurs fréquentes dans la valorisation des entreprises innovantes

  1. Utiliser des méthodes de startups traditionnelles sur une deeptech : Comparables SaaS ? Vous êtes hors sujet.
  2. Ne pas modéliser les jalons et leurs probabilités : Erreur #1, et très fréquente.
  3. Sous-estimer les coûts d’industrialisation ou d’essais cliniques : Retard = baisse de valorisation.
  4. Ignorer la propriété intellectuelle : Un brevet faible = une valo dramatiquement réduite.

Autre piège : les clauses de leaver mal définies

Un autre écueil, moins visible mais tout aussi critique, concerne les clauses de leaver dans les pactes d’associés. 

Dans les deeptech encore en phase de R&D, ces clauses prévoient souvent que les actions d’un fondateur good leaver soient rachetées à leur « valeur de marché ». Cette valeur est ensuite définie via une formule basée sur un multiple du chiffre d’affaires ou de l’EBITDA.

👉 Pour une entreprise qui ne génère pas encore de revenus, cela revient mécaniquement à valoriser les actions à 0 €, ce qui est totalement déconnecté de la réalité d’un projet dont la valeur repose sur la technologie, la propriété intellectuelle et les jalons R&D franchis.

Même si les textes permettent de solliciter un évaluateur indépendant, cela rallonge les discussions, crée des tensions inutiles pour le fondateur qui n’a ni le temps ni les moyens de rentrer en litige.

Ce cas illustre parfaitement pourquoi les méthodes standards ne fonctionnent pas pour les entreprises innovantes. Les pactes devraient exclure ces formules financières inadaptées et prévoir clairement une évaluation indépendante reposant sur des méthodes adaptées aux modèles deeptech.

Comment Sovalue valorise les entreprises innovantes

Chez Sovalue, nous avons développé une approche spécifique pour les entreprises technologiques complexes.

  • Modélisation fine des jalons R&D et des scénarios possibles : chaque étape est analysée séparément (probabilité, coût, valeur ajoutée).
  • Base de données dédiée à la Tech et à la Deeptech : 80 000 entreprises privées/publics + comparables sectoriels + transactions industrielles.
  • Analyses statistiques avancées : régressions, comparables ajustés, modèles multi-facteurs.
  • Valorisation claire, argumentée et défendable, à la fois pour les fondateurs, les investisseurs spécialisés et les boards.

👉 Vous travaillez sur une technologie innovante et souhaitez valoriser votre entreprise ? Prenez RDV avec un expert Sovalue pour en discuter.

À retenir

La valorisation d’entreprise innovante est un exercice particulier : elle dépend de la science, des jalons, de la propriété intellectuelle, de la capacité d’exécution et du niveau de risque technique.

Elle ne peut pas être modélisée comme une startup classique, et c’est précisément ce qui nécessite une méthodologie adaptée.

Sovalue accompagne les biotech, deeptech et startups innovantes pour produire une valorisation claire, robuste et conforme aux standards français et américains (409A).

Pour découvrir un exemple concret de valorisation dans l’univers biotech, vous pouvez consulter notre cas client. Nous y expliquons comment nous avons valorisé les BSPCE d’un CEO dans un contexte scientifique exigeant.

👉 Vous voulez anticiper votre prochaine levée ou valoriser votre technologie ? Prenez rendez-vous.

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Valoriser mon prix d’exercice des BSPCE avec Sovalue

Illan Glaubert

CEO, Sovalue AMF CIF | NYU Advanced Business Valuation | LLM in Tax Law | ex-Secondary market and Transfer Pricing advisor

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